表皮内水疱,系细胞的气球变性及网状变性所致,疱内惟见棘层松绑细胞及多核上皮巨细胞。真皮乳头水肿,可视血管外红细胞,真皮内程度不等的炎症细胞浸润,有嗜中性白细胞、淋巴细胞等。
目前诊断生殖器疱疹要害靠病史、症状和体征。在一些有条件的大医院可做病毒分开,用免疫荧光检查病毒包涵体,电镜检查病毒颗粒,酶联免疫吸附实验或射出免疫测量检测病毒抗原。